Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DSC2Q02487 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSC2Q02487 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSC2Q02487 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSC2Q02487 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms