Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MC1RQ01726 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MC1RQ01726 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MC1RQ01726 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MC1RQ01726 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms