Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSG6Q00889 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSG6Q00889 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSG6Q00889 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSG6Q00889 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSG6Q00889 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSG6Q00889 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSG6Q00889 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSG6Q00889 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSG6Q00889 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSG6Q00889 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms