Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKD1P98161 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKD1P98161 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKD1P98161 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKD1P98161 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKD1P98161 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKD1P98161 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKD1P98161 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKD1P98161 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKD1P98161 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKD1P98161 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PKD1P98161 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKD1P98161 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKD1P98161 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKD1P98161 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKD1P98161 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKD1P98161 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKD1P98161 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKD1P98161 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKD1P98161 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKD1P98161 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKD1P98161 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKD1P98161 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PKD1P98161 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PKD1P98161 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PKD1P98161 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKD1P98161 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKD1P98161 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKD1P98161 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKD1P98161 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKD1P98161 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKD1P98161 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKD1P98161 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKD1P98161 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKD1P98161 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKD1P98161 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKD1P98161 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKD1P98161 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKD1P98161 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKD1P98161 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKD1P98161 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKD1P98161 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKD1P98161 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKD1P98161 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKD1P98161 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKD1P98161 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKD1P98161 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKD1P98161 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PKD1P98161 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKD1P98161 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKD1P98161 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKD1P98161 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PKD1P98161 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PKD1P98161 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD1P98161 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD1P98161 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD1P98161 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD1P98161 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD1P98161 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD1P98161 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD1P98161 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD1P98161 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKD1P98161 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD1P98161 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD1P98161 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD1P98161 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD1P98161 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD1P98161 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKD1P98161 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD1P98161 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD1P98161 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD1P98161 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD1P98161 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD1P98161 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD1P98161 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PKD1P98161 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKD1P98161 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKD1P98161 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKD1P98161 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKD1P98161 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKD1P98161 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKD1P98161 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKD1P98161 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKD1P98161 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKD1P98161 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PKD1P98161 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKD1P98161 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKD1P98161 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKD1P98161 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKD1P98161 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKD1P98161 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKD1P98161 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKD1P98161 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKD1P98161 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKD1P98161 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKD1P98161 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKD1P98161 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PKD1P98161 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKD1P98161 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKD1P98161 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms