Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SKOR1P84550 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SKOR1P84550 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms