Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFI35P80217 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFI35P80217 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFI35P80217 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFI35P80217 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFI35P80217 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFI35P80217 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFI35P80217 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFI35P80217 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFI35P80217 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFI35P80217 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFI35P80217 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFI35P80217 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFI35P80217 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFI35P80217 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFI35P80217 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFI35P80217 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFI35P80217 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFI35P80217 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFI35P80217 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFI35P80217 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFI35P80217 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFI35P80217 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFI35P80217 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFI35P80217 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFI35P80217 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFI35P80217 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFI35P80217 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFI35P80217 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFI35P80217 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFI35P80217 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IFI35P80217 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFI35P80217 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFI35P80217 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFI35P80217 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFI35P80217 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFI35P80217 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFI35P80217 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFI35P80217 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFI35P80217 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFI35P80217 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFI35P80217 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFI35P80217 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFI35P80217 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFI35P80217 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFI35P80217 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFI35P80217 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFI35P80217 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFI35P80217 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFI35P80217 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFI35P80217 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFI35P80217 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFI35P80217 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFI35P80217 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFI35P80217 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFI35P80217 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFI35P80217 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFI35P80217 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFI35P80217 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFI35P80217 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFI35P80217 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFI35P80217 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFI35P80217 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFI35P80217 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFI35P80217 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFI35P80217 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFI35P80217 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFI35P80217 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFI35P80217 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IFI35P80217 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFI35P80217 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFI35P80217 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IFI35P80217 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFI35P80217 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFI35P80217 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFI35P80217 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFI35P80217 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFI35P80217 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFI35P80217 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFI35P80217 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFI35P80217 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFI35P80217 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFI35P80217 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFI35P80217 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFI35P80217 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFI35P80217 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFI35P80217 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFI35P80217 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFI35P80217 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFI35P80217 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFI35P80217 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFI35P80217 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFI35P80217 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFI35P80217 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFI35P80217 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFI35P80217 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFI35P80217 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFI35P80217 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IFI35P80217 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFI35P80217 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms