Protein–RNA interactions for Protein: P78334

GABRE, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABREP78334 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABREP78334 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABREP78334 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABREP78334 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABREP78334 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABREP78334 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABREP78334 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GABREP78334 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABREP78334 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABREP78334 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABREP78334 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABREP78334 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABREP78334 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABREP78334 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABREP78334 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABREP78334 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABREP78334 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABREP78334 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABREP78334 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABREP78334 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABREP78334 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABREP78334 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABREP78334 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABREP78334 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABREP78334 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABREP78334 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GABREP78334 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABREP78334 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABREP78334 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABREP78334 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABREP78334 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABREP78334 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABREP78334 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABREP78334 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABREP78334 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABREP78334 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABREP78334 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABREP78334 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABREP78334 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABREP78334 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABREP78334 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GABREP78334 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABREP78334 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABREP78334 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABREP78334 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABREP78334 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABREP78334 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABREP78334 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABREP78334 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABREP78334 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABREP78334 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABREP78334 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABREP78334 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABREP78334 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABREP78334 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABREP78334 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABREP78334 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABREP78334 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABREP78334 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABREP78334 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GABREP78334 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GABREP78334 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GABREP78334 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABREP78334 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABREP78334 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABREP78334 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABREP78334 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABREP78334 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABREP78334 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABREP78334 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABREP78334 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABREP78334 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABREP78334 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABREP78334 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABREP78334 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABREP78334 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABREP78334 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABREP78334 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABREP78334 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABREP78334 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABREP78334 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABREP78334 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABREP78334 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABREP78334 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABREP78334 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABREP78334 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABREP78334 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABREP78334 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GABREP78334 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABREP78334 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABREP78334 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABREP78334 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABREP78334 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABREP78334 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABREP78334 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABREP78334 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABREP78334 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABREP78334 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABREP78334 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABREP78334 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms