Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKP1P63208 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKP1P63208 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKP1P63208 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKP1P63208 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKP1P63208 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKP1P63208 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKP1P63208 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKP1P63208 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKP1P63208 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKP1P63208 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKP1P63208 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SKP1P63208 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SKP1P63208 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKP1P63208 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKP1P63208 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKP1P63208 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKP1P63208 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKP1P63208 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKP1P63208 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKP1P63208 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKP1P63208 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKP1P63208 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKP1P63208 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKP1P63208 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKP1P63208 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKP1P63208 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKP1P63208 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKP1P63208 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKP1P63208 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKP1P63208 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SKP1P63208 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKP1P63208 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SKP1P63208 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKP1P63208 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKP1P63208 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKP1P63208 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKP1P63208 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKP1P63208 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKP1P63208 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKP1P63208 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKP1P63208 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKP1P63208 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKP1P63208 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKP1P63208 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKP1P63208 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKP1P63208 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKP1P63208 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKP1P63208 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKP1P63208 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKP1P63208 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKP1P63208 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKP1P63208 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKP1P63208 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKP1P63208 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKP1P63208 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKP1P63208 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKP1P63208 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKP1P63208 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKP1P63208 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKP1P63208 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKP1P63208 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKP1P63208 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKP1P63208 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKP1P63208 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKP1P63208 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKP1P63208 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKP1P63208 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKP1P63208 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKP1P63208 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKP1P63208 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKP1P63208 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKP1P63208 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKP1P63208 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKP1P63208 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKP1P63208 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKP1P63208 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKP1P63208 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKP1P63208 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKP1P63208 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKP1P63208 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKP1P63208 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SKP1P63208 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKP1P63208 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKP1P63208 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKP1P63208 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKP1P63208 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKP1P63208 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKP1P63208 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKP1P63208 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKP1P63208 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKP1P63208 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKP1P63208 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKP1P63208 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKP1P63208 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKP1P63208 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKP1P63208 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKP1P63208 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKP1P63208 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SKP1P63208 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms