Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL23AP62750 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL23AP62750 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL23AP62750 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms