Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNRPFP62306 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNRPFP62306 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SNRPFP62306 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNRPFP62306 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNRPFP62306 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNRPFP62306 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNRPFP62306 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNRPFP62306 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNRPFP62306 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNRPFP62306 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNRPFP62306 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNRPFP62306 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNRPFP62306 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNRPFP62306 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms