Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERV-K104P61576 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HERV-K104P61576 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERV-K104P61576 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms