Protein–RNA interactions for Protein: P61353

RPL27, 60S ribosomal protein L27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27P61353 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL27P61353 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL27P61353 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL27P61353 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL27P61353 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL27P61353 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL27P61353 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL27P61353 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL27P61353 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL27P61353 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL27P61353 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL27P61353 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL27P61353 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL27P61353 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL27P61353 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL27P61353 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL27P61353 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL27P61353 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL27P61353 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL27P61353 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL27P61353 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL27P61353 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL27P61353 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL27P61353 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL27P61353 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL27P61353 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL27P61353 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL27P61353 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL27P61353 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL27P61353 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL27P61353 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL27P61353 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL27P61353 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL27P61353 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL27P61353 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL27P61353 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL27P61353 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL27P61353 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL27P61353 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL27P61353 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL27P61353 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL27P61353 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL27P61353 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL27P61353 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL27P61353 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL27P61353 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL27P61353 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL27P61353 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL27P61353 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL27P61353 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL27P61353 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL27P61353 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL27P61353 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL27P61353 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL27P61353 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL27P61353 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL27P61353 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL27P61353 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL27P61353 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL27P61353 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL27P61353 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL27P61353 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL27P61353 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL27P61353 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL27P61353 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL27P61353 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL27P61353 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL27P61353 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL27P61353 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL27P61353 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL27P61353 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL27P61353 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL27P61353 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL27P61353 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL27P61353 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL27P61353 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL27P61353 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL27P61353 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL27P61353 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL27P61353 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL27P61353 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL27P61353 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL27P61353 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL27P61353 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL27P61353 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL27P61353 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL27P61353 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL27P61353 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL27P61353 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL27P61353 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL27P61353 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL27P61353 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL27P61353 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL27P61353 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL27P61353 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL27P61353 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL27P61353 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL27P61353 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL27P61353 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL27P61353 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms