Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SNAP25P60880 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNAP25P60880 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNAP25P60880 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNAP25P60880 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNAP25P60880 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNAP25P60880 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNAP25P60880 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNAP25P60880 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNAP25P60880 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNAP25P60880 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNAP25P60880 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNAP25P60880 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNAP25P60880 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SNAP25P60880 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNAP25P60880 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNAP25P60880 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNAP25P60880 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNAP25P60880 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNAP25P60880 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNAP25P60880 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms