Protein–RNA interactions for Protein: P60510

PPP4C, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4CP60510 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPP4CP60510 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPP4CP60510 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPP4CP60510 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PPP4CP60510 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPP4CP60510 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPP4CP60510 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPP4CP60510 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPP4CP60510 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPP4CP60510 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PPP4CP60510 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PPP4CP60510 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPP4CP60510 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PPP4CP60510 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPP4CP60510 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPP4CP60510 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPP4CP60510 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPP4CP60510 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPP4CP60510 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPP4CP60510 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPP4CP60510 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPP4CP60510 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPP4CP60510 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PPP4CP60510 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPP4CP60510 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPP4CP60510 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPP4CP60510 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPP4CP60510 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPP4CP60510 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPP4CP60510 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPP4CP60510 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPP4CP60510 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPP4CP60510 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPP4CP60510 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPP4CP60510 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPP4CP60510 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPP4CP60510 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPP4CP60510 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms