Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTENP60484 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTENP60484 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTENP60484 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTENP60484 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTENP60484 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTENP60484 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTENP60484 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTENP60484 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTENP60484 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTENP60484 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTENP60484 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTENP60484 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTENP60484 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTENP60484 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTENP60484 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTENP60484 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTENP60484 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTENP60484 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTENP60484 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTENP60484 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTENP60484 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTENP60484 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTENP60484 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTENP60484 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTENP60484 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTENP60484 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTENP60484 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTENP60484 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTENP60484 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTENP60484 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTENP60484 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTENP60484 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTENP60484 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTENP60484 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTENP60484 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTENP60484 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTENP60484 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTENP60484 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTENP60484 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTENP60484 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTENP60484 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTENP60484 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTENP60484 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTENP60484 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTENP60484 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PTENP60484 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTENP60484 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTENP60484 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTENP60484 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTENP60484 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTENP60484 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTENP60484 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTENP60484 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTENP60484 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTENP60484 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTENP60484 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTENP60484 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTENP60484 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTENP60484 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTENP60484 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTENP60484 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTENP60484 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTENP60484 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTENP60484 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTENP60484 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTENP60484 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTENP60484 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTENP60484 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTENP60484 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTENP60484 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTENP60484 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTENP60484 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTENP60484 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTENP60484 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTENP60484 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTENP60484 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTENP60484 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTENP60484 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTENP60484 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTENP60484 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTENP60484 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTENP60484 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTENP60484 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTENP60484 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTENP60484 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTENP60484 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTENP60484 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PTENP60484 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTENP60484 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTENP60484 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTENP60484 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTENP60484 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTENP60484 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTENP60484 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTENP60484 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTENP60484 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTENP60484 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTENP60484 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTENP60484 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms