Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATP5EP56381 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP5EP56381 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.6 ms