Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP9P55211 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP9P55211 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP9P55211 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP9P55211 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP9P55211 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP9P55211 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASP9P55211 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP9P55211 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP9P55211 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP9P55211 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP9P55211 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP9P55211 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP9P55211 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP9P55211 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP9P55211 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASP9P55211 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP9P55211 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP9P55211 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP9P55211 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP9P55211 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP9P55211 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP9P55211 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP9P55211 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP9P55211 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASP9P55211 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP9P55211 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASP9P55211 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP9P55211 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP9P55211 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP9P55211 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP9P55211 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP9P55211 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP9P55211 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP9P55211 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP9P55211 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP9P55211 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CASP9P55211 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP9P55211 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP9P55211 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP9P55211 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP9P55211 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CASP9P55211 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASP9P55211 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CASP9P55211 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP9P55211 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP9P55211 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP9P55211 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP9P55211 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP9P55211 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP9P55211 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CASP9P55211 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP9P55211 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP9P55211 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP9P55211 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP9P55211 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP9P55211 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP9P55211 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP9P55211 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASP9P55211 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP9P55211 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP9P55211 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP9P55211 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP9P55211 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP9P55211 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP9P55211 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP9P55211 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP9P55211 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP9P55211 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASP9P55211 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP9P55211 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP9P55211 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP9P55211 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP9P55211 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASP9P55211 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP9P55211 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP9P55211 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP9P55211 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASP9P55211 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP9P55211 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP9P55211 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP9P55211 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP9P55211 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP9P55211 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP9P55211 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP9P55211 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP9P55211 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP9P55211 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP9P55211 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP9P55211 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP9P55211 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP9P55211 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP9P55211 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP9P55211 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP9P55211 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP9P55211 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP9P55211 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP9P55211 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP9P55211 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP9P55211 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms