Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A2P55011 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A2P55011 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A2P55011 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A2P55011 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A2P55011 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A2P55011 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A2P55011 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A2P55011 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC12A2P55011 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC12A2P55011 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC12A2P55011 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC12A2P55011 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC12A2P55011 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms