Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRLP54845 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRLP54845 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRLP54845 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRLP54845 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRLP54845 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NRLP54845 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRLP54845 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRLP54845 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRLP54845 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRLP54845 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRLP54845 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRLP54845 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRLP54845 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRLP54845 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRLP54845 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRLP54845 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRLP54845 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRLP54845 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRLP54845 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRLP54845 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NRLP54845 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRLP54845 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRLP54845 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRLP54845 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRLP54845 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRLP54845 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRLP54845 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRLP54845 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRLP54845 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NRLP54845 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRLP54845 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRLP54845 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRLP54845 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRLP54845 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRLP54845 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRLP54845 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRLP54845 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NRLP54845 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NRLP54845 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRLP54845 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRLP54845 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRLP54845 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRLP54845 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRLP54845 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRLP54845 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRLP54845 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRLP54845 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRLP54845 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRLP54845 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRLP54845 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRLP54845 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRLP54845 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NRLP54845 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRLP54845 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRLP54845 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRLP54845 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRLP54845 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NRLP54845 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRLP54845 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRLP54845 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRLP54845 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRLP54845 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NRLP54845 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRLP54845 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRLP54845 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NRLP54845 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRLP54845 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRLP54845 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRLP54845 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NRLP54845 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NRLP54845 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NRLP54845 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRLP54845 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRLP54845 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRLP54845 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRLP54845 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRLP54845 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRLP54845 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRLP54845 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRLP54845 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRLP54845 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRLP54845 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRLP54845 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRLP54845 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRLP54845 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRLP54845 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NRLP54845 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NRLP54845 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRLP54845 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRLP54845 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRLP54845 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRLP54845 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRLP54845 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRLP54845 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRLP54845 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRLP54845 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRLP54845 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRLP54845 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRLP54845 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms