Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAA2P54646 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKAA2P54646 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAA2P54646 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms