Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMS2P54278 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMS2P54278 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PMS2P54278 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMS2P54278 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMS2P54278 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMS2P54278 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMS2P54278 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMS2P54278 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMS2P54278 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PMS2P54278 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMS2P54278 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMS2P54278 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMS2P54278 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMS2P54278 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMS2P54278 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMS2P54278 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMS2P54278 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMS2P54278 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMS2P54278 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMS2P54278 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMS2P54278 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMS2P54278 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMS2P54278 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMS2P54278 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PMS2P54278 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PMS2P54278 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PMS2P54278 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PMS2P54278 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PMS2P54278 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMS2P54278 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PMS2P54278 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PMS2P54278 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PMS2P54278 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMS2P54278 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMS2P54278 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMS2P54278 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMS2P54278 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMS2P54278 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMS2P54278 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMS2P54278 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMS2P54278 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMS2P54278 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS2P54278 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS2P54278 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS2P54278 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS2P54278 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS2P54278 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS2P54278 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS2P54278 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS2P54278 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS2P54278 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS2P54278 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS2P54278 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS2P54278 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMS2P54278 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PMS2P54278 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMS2P54278 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMS2P54278 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMS2P54278 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMS2P54278 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMS2P54278 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMS2P54278 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMS2P54278 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMS2P54278 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMS2P54278 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMS2P54278 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMS2P54278 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMS2P54278 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMS2P54278 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMS2P54278 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMS2P54278 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PMS2P54278 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMS2P54278 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMS2P54278 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS2P54278 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS2P54278 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS2P54278 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS2P54278 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS2P54278 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS2P54278 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS2P54278 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PMS2P54278 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMS2P54278 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMS2P54278 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMS2P54278 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMS2P54278 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMS2P54278 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMS2P54278 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMS2P54278 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMS2P54278 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMS2P54278 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMS2P54278 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMS2P54278 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PMS2P54278 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMS2P54278 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PMS2P54278 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMS2P54278 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMS2P54278 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMS2P54278 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms