Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATXN3P54252 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATXN3P54252 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATXN3P54252 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATXN3P54252 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms