Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AP2S1P53680 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AP2S1P53680 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP2S1P53680 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms