Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LBX1P52954 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LBX1P52954 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LBX1P52954 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LBX1P52954 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LBX1P52954 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LBX1P52954 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LBX1P52954 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LBX1P52954 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LBX1P52954 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LBX1P52954 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LBX1P52954 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LBX1P52954 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LBX1P52954 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LBX1P52954 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LBX1P52954 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LBX1P52954 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LBX1P52954 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LBX1P52954 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LBX1P52954 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LBX1P52954 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LBX1P52954 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LBX1P52954 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LBX1P52954 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LBX1P52954 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LBX1P52954 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LBX1P52954 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LBX1P52954 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LBX1P52954 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LBX1P52954 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LBX1P52954 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LBX1P52954 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LBX1P52954 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LBX1P52954 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LBX1P52954 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LBX1P52954 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LBX1P52954 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LBX1P52954 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LBX1P52954 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LBX1P52954 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LBX1P52954 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
LBX1P52954 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LBX1P52954 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LBX1P52954 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LBX1P52954 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LBX1P52954 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LBX1P52954 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LBX1P52954 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LBX1P52954 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LBX1P52954 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LBX1P52954 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LBX1P52954 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LBX1P52954 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LBX1P52954 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LBX1P52954 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LBX1P52954 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LBX1P52954 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LBX1P52954 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LBX1P52954 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LBX1P52954 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LBX1P52954 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LBX1P52954 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LBX1P52954 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LBX1P52954 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LBX1P52954 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LBX1P52954 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LBX1P52954 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LBX1P52954 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LBX1P52954 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LBX1P52954 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LBX1P52954 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LBX1P52954 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LBX1P52954 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LBX1P52954 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LBX1P52954 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LBX1P52954 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LBX1P52954 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LBX1P52954 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LBX1P52954 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LBX1P52954 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LBX1P52954 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LBX1P52954 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LBX1P52954 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LBX1P52954 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LBX1P52954 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LBX1P52954 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LBX1P52954 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LBX1P52954 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LBX1P52954 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LBX1P52954 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LBX1P52954 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LBX1P52954 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LBX1P52954 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LBX1P52954 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LBX1P52954 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LBX1P52954 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LBX1P52954 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LBX1P52954 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LBX1P52954 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LBX1P52954 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms