Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NKX2-5P52952 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NKX2-5P52952 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NKX2-5P52952 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NKX2-5P52952 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms