Protein–RNA interactions for Protein: P52815

MRPL12, 39S ribosomal protein L12, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL12P52815 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MRPL12P52815 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MRPL12P52815 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MRPL12P52815 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MRPL12P52815 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms