Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGDP52209 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGDP52209 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGDP52209 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGDP52209 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGDP52209 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGDP52209 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGDP52209 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGDP52209 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PGDP52209 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGDP52209 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGDP52209 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGDP52209 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGDP52209 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGDP52209 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGDP52209 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGDP52209 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGDP52209 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGDP52209 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGDP52209 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PGDP52209 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGDP52209 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGDP52209 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PGDP52209 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGDP52209 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGDP52209 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGDP52209 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGDP52209 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGDP52209 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGDP52209 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PGDP52209 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGDP52209 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGDP52209 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGDP52209 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGDP52209 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGDP52209 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGDP52209 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGDP52209 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGDP52209 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGDP52209 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGDP52209 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PGDP52209 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGDP52209 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGDP52209 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGDP52209 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGDP52209 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGDP52209 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGDP52209 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGDP52209 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PGDP52209 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGDP52209 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGDP52209 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGDP52209 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGDP52209 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGDP52209 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGDP52209 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGDP52209 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGDP52209 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGDP52209 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGDP52209 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PGDP52209 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGDP52209 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PGDP52209 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PGDP52209 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGDP52209 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGDP52209 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGDP52209 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGDP52209 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PGDP52209 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGDP52209 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGDP52209 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGDP52209 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGDP52209 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGDP52209 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PGDP52209 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGDP52209 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGDP52209 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGDP52209 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGDP52209 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGDP52209 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGDP52209 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGDP52209 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGDP52209 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGDP52209 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGDP52209 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGDP52209 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGDP52209 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGDP52209 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGDP52209 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGDP52209 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGDP52209 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGDP52209 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGDP52209 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGDP52209 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGDP52209 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGDP52209 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGDP52209 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGDP52209 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGDP52209 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGDP52209 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms