Protein–RNA interactions for Protein: P51826

AFF3, AF4/FMR2 family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF3P51826 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AFF3P51826 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AFF3P51826 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF3P51826 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF3P51826 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF3P51826 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF3P51826 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF3P51826 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFF3P51826 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFF3P51826 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFF3P51826 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AFF3P51826 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFF3P51826 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF3P51826 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF3P51826 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF3P51826 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF3P51826 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF3P51826 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF3P51826 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF3P51826 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF3P51826 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF3P51826 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF3P51826 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF3P51826 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFF3P51826 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFF3P51826 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFF3P51826 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFF3P51826 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFF3P51826 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFF3P51826 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFF3P51826 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF3P51826 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF3P51826 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF3P51826 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF3P51826 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF3P51826 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF3P51826 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF3P51826 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF3P51826 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF3P51826 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF3P51826 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF3P51826 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF3P51826 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF3P51826 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF3P51826 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFF3P51826 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFF3P51826 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFF3P51826 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFF3P51826 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFF3P51826 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFF3P51826 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF3P51826 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF3P51826 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF3P51826 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF3P51826 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF3P51826 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF3P51826 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF3P51826 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFF3P51826 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFF3P51826 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFF3P51826 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFF3P51826 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFF3P51826 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFF3P51826 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AFF3P51826 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AFF3P51826 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AFF3P51826 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFF3P51826 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFF3P51826 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFF3P51826 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFF3P51826 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFF3P51826 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFF3P51826 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFF3P51826 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AFF3P51826 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFF3P51826 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AFF3P51826 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFF3P51826 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFF3P51826 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFF3P51826 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF3P51826 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF3P51826 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF3P51826 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF3P51826 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF3P51826 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF3P51826 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF3P51826 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF3P51826 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF3P51826 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF3P51826 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF3P51826 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF3P51826 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFF3P51826 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFF3P51826 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFF3P51826 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFF3P51826 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
AFF3P51826 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFF3P51826 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFF3P51826 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFF3P51826 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms