Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB28P51157 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB28P51157 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB28P51157 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB28P51157 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB28P51157 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB28P51157 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB28P51157 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB28P51157 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB28P51157 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB28P51157 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB28P51157 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB28P51157 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB28P51157 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB28P51157 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB28P51157 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB28P51157 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB28P51157 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB28P51157 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB28P51157 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB28P51157 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB28P51157 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB28P51157 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB28P51157 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB28P51157 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB28P51157 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB28P51157 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB28P51157 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB28P51157 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB28P51157 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB28P51157 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB28P51157 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB28P51157 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB28P51157 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB28P51157 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB28P51157 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB28P51157 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB28P51157 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB28P51157 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB28P51157 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB28P51157 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB28P51157 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB28P51157 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB28P51157 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB28P51157 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB28P51157 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB28P51157 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB28P51157 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB28P51157 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB28P51157 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB28P51157 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB28P51157 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB28P51157 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB28P51157 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB28P51157 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB28P51157 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB28P51157 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB28P51157 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB28P51157 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB28P51157 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB28P51157 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB28P51157 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB28P51157 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB28P51157 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB28P51157 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB28P51157 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB28P51157 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB28P51157 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB28P51157 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB28P51157 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB28P51157 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB28P51157 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB28P51157 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB28P51157 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB28P51157 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB28P51157 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB28P51157 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB28P51157 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB28P51157 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB28P51157 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB28P51157 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB28P51157 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB28P51157 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB28P51157 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB28P51157 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB28P51157 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB28P51157 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB28P51157 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB28P51157 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB28P51157 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB28P51157 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB28P51157 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB28P51157 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB28P51157 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB28P51157 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB28P51157 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB28P51157 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB28P51157 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB28P51157 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB28P51157 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms