Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHX2P50458 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX2P50458 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX2P50458 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX2P50458 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX2P50458 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX2P50458 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHX2P50458 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX2P50458 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX2P50458 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX2P50458 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX2P50458 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX2P50458 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX2P50458 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX2P50458 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX2P50458 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX2P50458 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX2P50458 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX2P50458 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX2P50458 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX2P50458 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX2P50458 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX2P50458 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX2P50458 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX2P50458 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX2P50458 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX2P50458 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX2P50458 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX2P50458 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX2P50458 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX2P50458 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX2P50458 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX2P50458 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX2P50458 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX2P50458 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX2P50458 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX2P50458 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX2P50458 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX2P50458 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX2P50458 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX2P50458 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX2P50458 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX2P50458 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX2P50458 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX2P50458 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX2P50458 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX2P50458 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX2P50458 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX2P50458 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX2P50458 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX2P50458 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX2P50458 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX2P50458 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX2P50458 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX2P50458 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX2P50458 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX2P50458 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX2P50458 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX2P50458 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX2P50458 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX2P50458 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX2P50458 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX2P50458 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX2P50458 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX2P50458 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX2P50458 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX2P50458 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX2P50458 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX2P50458 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX2P50458 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX2P50458 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX2P50458 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX2P50458 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX2P50458 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX2P50458 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX2P50458 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX2P50458 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX2P50458 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX2P50458 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX2P50458 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX2P50458 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX2P50458 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX2P50458 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX2P50458 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX2P50458 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX2P50458 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX2P50458 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX2P50458 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX2P50458 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX2P50458 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX2P50458 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX2P50458 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX2P50458 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX2P50458 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX2P50458 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX2P50458 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX2P50458 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX2P50458 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX2P50458 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX2P50458 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms