Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMAN1P49257 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMAN1P49257 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LMAN1P49257 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMAN1P49257 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms