Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGM4P49221 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TGM4P49221 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGM4P49221 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGM4P49221 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGM4P49221 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGM4P49221 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGM4P49221 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGM4P49221 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TGM4P49221 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TGM4P49221 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TGM4P49221 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGM4P49221 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGM4P49221 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGM4P49221 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGM4P49221 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGM4P49221 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGM4P49221 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGM4P49221 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGM4P49221 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGM4P49221 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGM4P49221 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGM4P49221 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGM4P49221 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGM4P49221 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGM4P49221 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM4P49221 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM4P49221 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM4P49221 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM4P49221 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM4P49221 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM4P49221 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM4P49221 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM4P49221 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM4P49221 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM4P49221 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGM4P49221 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGM4P49221 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGM4P49221 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGM4P49221 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGM4P49221 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGM4P49221 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGM4P49221 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGM4P49221 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGM4P49221 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGM4P49221 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGM4P49221 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGM4P49221 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGM4P49221 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGM4P49221 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TGM4P49221 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGM4P49221 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGM4P49221 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM4P49221 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM4P49221 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM4P49221 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM4P49221 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM4P49221 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM4P49221 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM4P49221 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM4P49221 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM4P49221 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM4P49221 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM4P49221 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM4P49221 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGM4P49221 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGM4P49221 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGM4P49221 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGM4P49221 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGM4P49221 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGM4P49221 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGM4P49221 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGM4P49221 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGM4P49221 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGM4P49221 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGM4P49221 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGM4P49221 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGM4P49221 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGM4P49221 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM4P49221 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM4P49221 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM4P49221 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM4P49221 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM4P49221 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGM4P49221 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGM4P49221 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGM4P49221 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM4P49221 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM4P49221 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM4P49221 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM4P49221 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM4P49221 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM4P49221 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM4P49221 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM4P49221 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM4P49221 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGM4P49221 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGM4P49221 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGM4P49221 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGM4P49221 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 510.7 ms