Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTDSS1P48651 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTDSS1P48651 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTDSS1P48651 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms