Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNJ1P48048 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNJ1P48048 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms