Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRXP46100 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRXP46100 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRXP46100 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRXP46100 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRXP46100 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRXP46100 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRXP46100 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRXP46100 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRXP46100 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRXP46100 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRXP46100 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRXP46100 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRXP46100 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRXP46100 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRXP46100 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRXP46100 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRXP46100 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRXP46100 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRXP46100 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRXP46100 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRXP46100 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRXP46100 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRXP46100 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRXP46100 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRXP46100 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRXP46100 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRXP46100 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRXP46100 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRXP46100 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRXP46100 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRXP46100 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATRXP46100 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRXP46100 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRXP46100 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRXP46100 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRXP46100 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRXP46100 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRXP46100 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRXP46100 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRXP46100 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRXP46100 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRXP46100 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRXP46100 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRXP46100 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRXP46100 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRXP46100 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRXP46100 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRXP46100 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRXP46100 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRXP46100 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRXP46100 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRXP46100 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRXP46100 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRXP46100 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRXP46100 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRXP46100 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRXP46100 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRXP46100 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRXP46100 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRXP46100 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRXP46100 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRXP46100 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRXP46100 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRXP46100 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRXP46100 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRXP46100 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRXP46100 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRXP46100 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRXP46100 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRXP46100 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATRXP46100 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRXP46100 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATRXP46100 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATRXP46100 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATRXP46100 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRXP46100 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRXP46100 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRXP46100 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRXP46100 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATRXP46100 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRXP46100 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRXP46100 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRXP46100 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRXP46100 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRXP46100 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRXP46100 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATRXP46100 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRXP46100 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRXP46100 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRXP46100 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRXP46100 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRXP46100 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRXP46100 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRXP46100 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATRXP46100 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRXP46100 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRXP46100 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRXP46100 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRXP46100 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms