Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
XCR1P46094 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XCR1P46094 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XCR1P46094 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XCR1P46094 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XCR1P46094 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XCR1P46094 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XCR1P46094 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XCR1P46094 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XCR1P46094 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
XCR1P46094 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XCR1P46094 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
XCR1P46094 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XCR1P46094 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XCR1P46094 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XCR1P46094 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
XCR1P46094 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XCR1P46094 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XCR1P46094 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XCR1P46094 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XCR1P46094 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XCR1P46094 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XCR1P46094 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XCR1P46094 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XCR1P46094 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XCR1P46094 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XCR1P46094 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
XCR1P46094 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XCR1P46094 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XCR1P46094 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XCR1P46094 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XCR1P46094 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XCR1P46094 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XCR1P46094 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XCR1P46094 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XCR1P46094 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XCR1P46094 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XCR1P46094 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XCR1P46094 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XCR1P46094 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XCR1P46094 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XCR1P46094 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XCR1P46094 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XCR1P46094 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XCR1P46094 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XCR1P46094 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XCR1P46094 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XCR1P46094 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XCR1P46094 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XCR1P46094 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XCR1P46094 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XCR1P46094 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XCR1P46094 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XCR1P46094 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XCR1P46094 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XCR1P46094 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
XCR1P46094 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
XCR1P46094 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XCR1P46094 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XCR1P46094 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XCR1P46094 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XCR1P46094 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XCR1P46094 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XCR1P46094 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XCR1P46094 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XCR1P46094 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
XCR1P46094 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XCR1P46094 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XCR1P46094 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XCR1P46094 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XCR1P46094 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XCR1P46094 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XCR1P46094 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XCR1P46094 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XCR1P46094 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XCR1P46094 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XCR1P46094 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XCR1P46094 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XCR1P46094 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XCR1P46094 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XCR1P46094 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XCR1P46094 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XCR1P46094 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XCR1P46094 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XCR1P46094 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XCR1P46094 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XCR1P46094 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XCR1P46094 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XCR1P46094 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
XCR1P46094 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XCR1P46094 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XCR1P46094 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XCR1P46094 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XCR1P46094 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XCR1P46094 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XCR1P46094 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XCR1P46094 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XCR1P46094 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XCR1P46094 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XCR1P46094 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms