Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACAA2P42765 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACAA2P42765 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACAA2P42765 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms