Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PIK3CAP42336 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PIK3CAP42336 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3CAP42336 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3CAP42336 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms