Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP12P39900 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP12P39900 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP12P39900 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP12P39900 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MMP12P39900 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MMP12P39900 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP12P39900 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP12P39900 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP12P39900 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP12P39900 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP12P39900 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP12P39900 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP12P39900 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP12P39900 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP12P39900 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP12P39900 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP12P39900 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP12P39900 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP12P39900 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP12P39900 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP12P39900 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP12P39900 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP12P39900 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP12P39900 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP12P39900 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP12P39900 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP12P39900 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP12P39900 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP12P39900 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP12P39900 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP12P39900 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP12P39900 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP12P39900 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP12P39900 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP12P39900 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP12P39900 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP12P39900 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP12P39900 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP12P39900 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP12P39900 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP12P39900 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP12P39900 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP12P39900 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP12P39900 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP12P39900 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP12P39900 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP12P39900 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP12P39900 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP12P39900 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP12P39900 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP12P39900 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP12P39900 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP12P39900 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP12P39900 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP12P39900 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP12P39900 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP12P39900 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP12P39900 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP12P39900 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP12P39900 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP12P39900 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP12P39900 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP12P39900 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP12P39900 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP12P39900 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP12P39900 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP12P39900 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP12P39900 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP12P39900 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP12P39900 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP12P39900 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP12P39900 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP12P39900 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP12P39900 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP12P39900 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP12P39900 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP12P39900 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP12P39900 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP12P39900 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP12P39900 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP12P39900 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP12P39900 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP12P39900 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP12P39900 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP12P39900 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP12P39900 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP12P39900 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP12P39900 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP12P39900 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP12P39900 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP12P39900 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP12P39900 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP12P39900 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP12P39900 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP12P39900 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP12P39900 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP12P39900 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP12P39900 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMP12P39900 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms