Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGFBR1P36897 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGFBR1P36897 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGFBR1P36897 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGFBR1P36897 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms