Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDH5P33151 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDH5P33151 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDH5P33151 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDH5P33151 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDH5P33151 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH5P33151 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH5P33151 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH5P33151 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH5P33151 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH5P33151 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH5P33151 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH5P33151 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH5P33151 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH5P33151 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH5P33151 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH5P33151 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH5P33151 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH5P33151 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH5P33151 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH5P33151 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH5P33151 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH5P33151 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH5P33151 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH5P33151 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH5P33151 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH5P33151 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH5P33151 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH5P33151 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH5P33151 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH5P33151 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH5P33151 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH5P33151 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH5P33151 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH5P33151 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH5P33151 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH5P33151 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH5P33151 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH5P33151 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH5P33151 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH5P33151 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH5P33151 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH5P33151 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH5P33151 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH5P33151 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH5P33151 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH5P33151 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH5P33151 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH5P33151 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH5P33151 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH5P33151 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH5P33151 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH5P33151 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH5P33151 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH5P33151 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH5P33151 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH5P33151 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH5P33151 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH5P33151 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH5P33151 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH5P33151 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH5P33151 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH5P33151 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH5P33151 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH5P33151 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH5P33151 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH5P33151 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH5P33151 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH5P33151 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH5P33151 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH5P33151 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH5P33151 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH5P33151 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH5P33151 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH5P33151 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH5P33151 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH5P33151 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH5P33151 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH5P33151 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH5P33151 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH5P33151 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH5P33151 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH5P33151 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH5P33151 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH5P33151 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH5P33151 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH5P33151 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH5P33151 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH5P33151 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH5P33151 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH5P33151 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH5P33151 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH5P33151 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH5P33151 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH5P33151 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH5P33151 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH5P33151 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH5P33151 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH5P33151 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH5P33151 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms