Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2H1P32780 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2H1P32780 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2H1P32780 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms