Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDI1P31150 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDI1P31150 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDI1P31150 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDI1P31150 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDI1P31150 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDI1P31150 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDI1P31150 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDI1P31150 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDI1P31150 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDI1P31150 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDI1P31150 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDI1P31150 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDI1P31150 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDI1P31150 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDI1P31150 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDI1P31150 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDI1P31150 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDI1P31150 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDI1P31150 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDI1P31150 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GDI1P31150 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GDI1P31150 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDI1P31150 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDI1P31150 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDI1P31150 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDI1P31150 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDI1P31150 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDI1P31150 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDI1P31150 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDI1P31150 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDI1P31150 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDI1P31150 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDI1P31150 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDI1P31150 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDI1P31150 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDI1P31150 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDI1P31150 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDI1P31150 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDI1P31150 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GDI1P31150 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDI1P31150 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDI1P31150 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GDI1P31150 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDI1P31150 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDI1P31150 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDI1P31150 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDI1P31150 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDI1P31150 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDI1P31150 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDI1P31150 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDI1P31150 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDI1P31150 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDI1P31150 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDI1P31150 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GDI1P31150 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDI1P31150 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDI1P31150 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDI1P31150 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDI1P31150 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDI1P31150 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GDI1P31150 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDI1P31150 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDI1P31150 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDI1P31150 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDI1P31150 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDI1P31150 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GDI1P31150 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDI1P31150 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDI1P31150 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDI1P31150 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDI1P31150 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GDI1P31150 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GDI1P31150 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDI1P31150 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDI1P31150 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GDI1P31150 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDI1P31150 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDI1P31150 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDI1P31150 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDI1P31150 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDI1P31150 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDI1P31150 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDI1P31150 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDI1P31150 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDI1P31150 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDI1P31150 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDI1P31150 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDI1P31150 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDI1P31150 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDI1P31150 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDI1P31150 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDI1P31150 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDI1P31150 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDI1P31150 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDI1P31150 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDI1P31150 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDI1P31150 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDI1P31150 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDI1P31150 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms