Protein–RNA interactions for Protein: P30740

SERPINB1, Leukocyte elastase inhibitor, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB1P30740 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINB1P30740 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINB1P30740 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERPINB1P30740 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINB1P30740 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINB1P30740 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINB1P30740 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINB1P30740 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINB1P30740 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINB1P30740 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms