Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDC27P30260 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDC27P30260 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDC27P30260 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDC27P30260 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CDC27P30260 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CDC27P30260 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDC27P30260 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDC27P30260 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CDC27P30260 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CDC27P30260 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDC27P30260 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDC27P30260 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDC27P30260 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDC27P30260 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDC27P30260 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC27P30260 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC27P30260 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC27P30260 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC27P30260 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC27P30260 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC27P30260 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC27P30260 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC27P30260 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC27P30260 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDC27P30260 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDC27P30260 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDC27P30260 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDC27P30260 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDC27P30260 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDC27P30260 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDC27P30260 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDC27P30260 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDC27P30260 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDC27P30260 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDC27P30260 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDC27P30260 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDC27P30260 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDC27P30260 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDC27P30260 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC27P30260 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC27P30260 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC27P30260 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC27P30260 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDC27P30260 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDC27P30260 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDC27P30260 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDC27P30260 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDC27P30260 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDC27P30260 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDC27P30260 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CDC27P30260 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDC27P30260 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDC27P30260 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDC27P30260 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC27P30260 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC27P30260 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CDC27P30260 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC27P30260 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC27P30260 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDC27P30260 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDC27P30260 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDC27P30260 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDC27P30260 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDC27P30260 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDC27P30260 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDC27P30260 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC27P30260 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC27P30260 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC27P30260 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDC27P30260 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDC27P30260 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDC27P30260 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDC27P30260 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDC27P30260 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC27P30260 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC27P30260 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC27P30260 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC27P30260 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC27P30260 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC27P30260 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDC27P30260 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC27P30260 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDC27P30260 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC27P30260 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC27P30260 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC27P30260 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDC27P30260 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDC27P30260 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDC27P30260 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDC27P30260 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDC27P30260 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDC27P30260 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CDC27P30260 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC27P30260 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC27P30260 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC27P30260 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC27P30260 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC27P30260 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC27P30260 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms