Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CMPK1P30085 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMPK1P30085 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMPK1P30085 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMPK1P30085 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CMPK1P30085 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CMPK1P30085 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CMPK1P30085 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CMPK1P30085 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CMPK1P30085 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CMPK1P30085 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CMPK1P30085 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CMPK1P30085 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CMPK1P30085 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMPK1P30085 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMPK1P30085 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMPK1P30085 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms