Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MARCKSP29966 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MARCKSP29966 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MARCKSP29966 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms