Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARID4AP29374 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ARID4AP29374 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARID4AP29374 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARID4AP29374 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARID4AP29374 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARID4AP29374 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARID4AP29374 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID4AP29374 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID4AP29374 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID4AP29374 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID4AP29374 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID4AP29374 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARID4AP29374 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARID4AP29374 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARID4AP29374 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARID4AP29374 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARID4AP29374 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARID4AP29374 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARID4AP29374 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARID4AP29374 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARID4AP29374 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARID4AP29374 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARID4AP29374 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARID4AP29374 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARID4AP29374 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARID4AP29374 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARID4AP29374 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID4AP29374 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID4AP29374 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID4AP29374 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID4AP29374 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID4AP29374 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID4AP29374 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARID4AP29374 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID4AP29374 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID4AP29374 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID4AP29374 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARID4AP29374 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms