Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCD3P28288 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCD3P28288 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCD3P28288 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD3P28288 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD3P28288 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD3P28288 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD3P28288 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCD3P28288 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms