Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PLNP26678 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLNP26678 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PLNP26678 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLNP26678 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLNP26678 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLNP26678 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PLNP26678 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLNP26678 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLNP26678 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLNP26678 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLNP26678 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLNP26678 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLNP26678 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLNP26678 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLNP26678 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLNP26678 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLNP26678 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLNP26678 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PLNP26678 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLNP26678 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLNP26678 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLNP26678 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLNP26678 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLNP26678 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLNP26678 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLNP26678 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLNP26678 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLNP26678 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PLNP26678 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLNP26678 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLNP26678 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLNP26678 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLNP26678 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLNP26678 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PLNP26678 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PLNP26678 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLNP26678 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLNP26678 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLNP26678 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PLNP26678 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLNP26678 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLNP26678 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PLNP26678 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLNP26678 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLNP26678 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLNP26678 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PLNP26678 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLNP26678 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLNP26678 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLNP26678 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLNP26678 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLNP26678 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLNP26678 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLNP26678 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLNP26678 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLNP26678 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLNP26678 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLNP26678 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLNP26678 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLNP26678 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLNP26678 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLNP26678 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLNP26678 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLNP26678 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLNP26678 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLNP26678 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLNP26678 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PLNP26678 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLNP26678 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLNP26678 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLNP26678 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLNP26678 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLNP26678 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLNP26678 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLNP26678 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLNP26678 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLNP26678 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLNP26678 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PLNP26678 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLNP26678 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PLNP26678 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLNP26678 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLNP26678 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLNP26678 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLNP26678 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLNP26678 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLNP26678 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLNP26678 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLNP26678 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLNP26678 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLNP26678 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLNP26678 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLNP26678 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLNP26678 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLNP26678 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLNP26678 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLNP26678 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLNP26678 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLNP26678 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms